ගොඩක් Windows භවිතා කරන අය අසන ප්‍රශ්නයක්. ලිනක්ස් වල virus නැත්තෙම නැතිවුනත් එය නැති තරම්ය. ඒ කියන්නේ පසුගිය අවුරුදු 15 තුළ, අතේ ඇගිලි වලින් ගනන් කළ හැකි පමණක විතර වයිරස සංඛ්‍යයාවක් තමයි හදල තියෙන්නෙ. මෙයින් එකකටවත් විශාල හානියක් කිරීමට හැකිවී නැත.

ලිනක්ස් මෙලෙස සෑහෙන virus වලින් සුරක්‍ෂිත වීමට ප්‍රධාන හේතුවක් ලෙස එය භාවිතාකරන users ලගෙ සංස්කෘතිය සහ ක්‍රියා කලාපය ප්‍රධාන තැනක් ගනී. උදා: Windows වල බොහො දෙනෙක් ඉන්නෙ Admin විධියට. ඒම නිසා  දන්නෙම නැතුව spyware, virus වැනි දෑ ස්ථාපිත කිරීම පහසියි. එවිතරක් නොව, ‌Windows users ල, සමහරු නොසැලකිලිමත් ලෙස e-mail attachment විවෘත කිරීමට පුරුදු වූ සිටිති.

හැබැයි ලිනක්ස් වල නම් වැරදිලාවත් ඕන්නැති මෘදුකාංග root අවසරයක් නොමැතිව ස්ථාපිත කර ගත නොහැක. එයින් විශාල හානියක් මඟ හරවා ගත හැක.

user හැරුනහම ලිනක්ස් පද්ධතිය නිදහස් සහ විවෘත මෘදුකාංග (Free/Open Source) වීම ඉතා වැදගත් සාදකයකි. මන්ද සංවෘත මෘදුකාංග (closed source) මෙන් නොව, එම මෘදුකාංගය ලියූ අයට අමතරව, ඕනෑම කෙනෙකුට එය ලිවීමේදී සිදු වූ දෙොෂ (bugs) දැක බලා, නිවේදනය කොට, කැමති නම් සෑදීම පවා කළ හැක. Windows වල බොහෙො විට සිදු වෙන්නේ නරක පුද්ගලයින් විසින් දෙොෂ සොයා ගැන එය උපයෙොගිකර ගැනීම. එවැනි දෙොෂ සෑදිය හැක්කේ, එම මෘදුකාංගය ලිවූ සාමාගමට විතරයි.

ඉතින් මෙම හේතු ඇතුලු වෙනත් හේතු නිසා ග්නූ/ලිනක්ස් වඩාත්ම සුරක්‍ෂිත OS එකක් ලෙස සැලකිය හැක.